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Trouver le bon niveau de stimulation pour le travail et les relations constitue l’un des principaux défis de la vie. Parfois, nous retardons l’exécution de certaines tâches et mettons fin à des relations parce que le niveau de stimulation global ne correspond pas à nos préférences. Certaines situations sont trop peu stimulantes, ce qui nous fait ressentir de l’ennui et de l’apathie. D’autres situations, par contre, sont un peu trop stimulantes, ce qui nous fait ressentir du stress ou de l’anxiété. Entre ces deux niveaux de stimulation se trouve la zone de prédilection où nous nous sentons engagés avec attention, mais cette zone varie d’un individu à un autre.

Par chance, nous ne sommes pas obligés d’accepter toutes les situations telles qu’elles se présentent. Il nous est possible de prendre des mesures pour modifier le niveau de stimulation par défaut afin qu’il nous convienne mieux. Cela vient renforcer notre état de contrôle et notre flexibilité. (suite…)

Pouvez-vous en toute conscience admettre que lorsque vous passez 8 heures, voire plus, dans votre bureau, vous ne réalisez qu’une ou deux heures de travail réel et significatif ? Combien de jours de ce genre vous faut-il pour accepter qu’il est grand temps que vous revoyiez sérieusement votre motivation, votre conduite et l’objet de votre concentration ?

Quelle est la solution ? Dans de nombreux cas, une bonne solution est de vous accorder plus de temps libre. Bien souvent cette approche n’est pas intuitive, mais elle fonctionne.

Une raison simple expliquant cela est que lorsque l’on semble avoir beaucoup de temps de travail, il est facile de le gaspiller. Le pseudo-travail improductif se glisse dans chacune de nos journées… jusqu’à ce que la plus grande partie de chaque jour ne soit pas focalisée sur nos activités génératrices de plus-value. (suite…)

Avez-vous quelqu’un dans votre vie qui aime, occasionnellement ou fréquemment, vous faire part de sa frustration ?

Êtes-vous souvent l’oreille attentive ou l’épaule sur laquelle l’on peut pleurer ?

Jouer ces rôles peut parfois s’avérer précieux. Je crois d’ailleurs que c’est une bonne chose d’être sympathique et compréhensif lorsque vous le pouvez — si vous apportez véritablement de l’aide à l’autre personne. (suite…)

Lorsque vous souhaitez attirer et rencontrer une nouvelle personne, la première chose à faire, c’est de vous montrer plus sociable ; commencer à établir une certaine connexion avec ladite personne et essayer d’être aussi sympathique que possible.

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Chez les eucaryotes, l'ADN est organisé en domaines plus ou moins compactés, avec des taux de transcription plus ou moins élevés, et qui sont marqués différentiellement par un certain nombre de marques épigénétiques (méthylation de l'ADN, modifications post-traductionnelles des histones, variants d'histones, ). Il est fréquent d'essayer de corréler le niveau d'expression des gènes avec la présence ou l'absence d'une marque épigénétique à proximité des sites d’initiations de la transcription (raccourcis en TSS, pour transcription start sites ). Par exemple, pour reprendre la carte de chaleur de la figure 1C de l'article présentant la suite d'outils deepTools2 :

Figure 1C issue de l'article présentant la suite d'outils deepTools2. Piles de profils épigénétiques H3K4me3, H3K27me3 et H3K36me3 (tri-méthylations des lysines 4, 27 et 36 des histones 3) centrés sur les TSS, réparti par clustering en un groupe actif et un groupe inactif.

Pour générer ce type de figures, il est nécessaire d'être en possession d'une liste de sites d’initiation de la transcription. Et donc, de se poser cette question fondamentale :

La définition est triviale : un site d'initiation de la transcription désigne une position génomique où le processus de transcription (synthèse d'un ARN depuis une matrice d'ADN) s'initie. En général, il est surtout fait référence aux sites d'initiations de la transcription des gènes, et/ou d'éléments transposables. Souvent l'ARN produit est coiffé au niveau de la base correspondante au site d'initiation de la transcription. Il ne faut pas confondre le site d’initiation de la transcription avec le site d'initiation de la traduction : les deux étant séparés sur les ARN messagers par la région 5' non traduite (ou 5' untranslated region , 5'UTR).

Structure des gènes eucaryotes (traduit d'après une image Wikimedia Commons CC BY 4.0). TSS: site d'initiation de la transcription ().

Petite subtilité : si la première base transcrite se désigne par le "+1" de transcription, la base la précédant sur le brin d'ADN est par convention appelée le "-1" de transcription, donc sans base "0" de transcription.

Je connais principalement deux méthodes expérimentales d'identification de ces sites. Sans rentrer dans les détails :

Les deux approches ont leurs limites. Outre la différence évidente de débit, citons le fort taux de décrochage des transcriptases inverses, facteur limitant de la méthode d'extension d'amorce, mais aussi la complexité du protocole expérimental du CAGE, ainsi que son incapacité à détecter les sites d'initiations non coiffés au niveau des ARNs.

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